Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IFFO1Q0D2I5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms