Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPN12Q05209 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN12Q05209 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms