Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCNT1Q02742 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms