Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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PTPRCP08575 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRCP08575 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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