Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPLO60437 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPLO60437 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPLO60437 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPLO60437 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPLO60437 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms