Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3AO14802 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR3AO14802 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms