Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ERVV-2B6SEH9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms