Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PALM3A6NDB9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms