Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GDE1Q9NZC3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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