Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DMRT3Q9NQL9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms