Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOL4Q9BPW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms