Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms