Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COG3Q96JB2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG3Q96JB2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms