Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRNP1Q6NT89 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms