Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDSS1Q5T2R2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms