Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms