Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms