Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HIF1AQ16665 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HIF1AQ16665 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HIF1AQ16665 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HIF1AQ16665 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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HIF1AQ16665 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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HIF1AQ16665 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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