Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SYPL1Q16563 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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