Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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