Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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