Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HDAC1Q13547 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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