Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRSF6Q13247 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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