Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF5Q13243 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF5Q13243 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms