Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM2Q13029 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
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