Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF2Q12933 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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