Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms