Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPN11Q06124 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPN11Q06124 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms