Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNB3Q05901 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms