Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms