Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2NP61088 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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