Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB10P61026 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB10P61026 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB10P61026 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB10P61026 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB10P61026 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB10P61026 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms