Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KDM5CP41229 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms