Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPS1P31327 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPS1P31327 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms