Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFTRP13569 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFTRP13569 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms