Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PPFIA3O75145 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms