Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC9O60706 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC9O60706 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC9O60706 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC9O60706 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ABCC9O60706 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ABCC9O60706 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms