Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP9BO43861 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms