Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CEP290O15078 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CEP290O15078 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CEP290O15078 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CEP290O15078 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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CEP290O15078 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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CEP290O15078 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP290O15078 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP290O15078 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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