Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM6BO15054 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms