Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVV-2B6SEH9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms