Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms