Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
L1RE1Q9UN81 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms