Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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USP18Q9UMW8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
USP18Q9UMW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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