Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms