Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SPASTQ9UBP0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms