Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CC2D2AQ9P2K1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CC2D2AQ9P2K1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms