Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MIS18AQ9NYP9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms