Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC22A11Q9NSA0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC22A11Q9NSA0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms