Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms